Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3BRM9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3BRM9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3BRM9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H3BRM9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H3BRM9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3BRM9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3BRM9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3BRM9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3BRM9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3BRM9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3BRM9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3BRM9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
H3BRM9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3BRM9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3BRM9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3BRM9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3BRM9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3BRM9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3BRM9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3BRM9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3BRM9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms