Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YJEFN3A6XGL0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YJEFN3A6XGL0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms