Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD8B2A6NJW9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8B2A6NJW9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms