Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRGMA1A4Y4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRGMA1A4Y4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms