Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXX1

IGHV5-10-1, Immunoglobulin heavy variable 5-10-1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms