Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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