Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms