Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms