Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms