Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms