Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms