Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms