Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms