Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP24386 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP24386 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP24386 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms