Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms