Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms