Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCEO43556 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCEO43556 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCEO43556 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCEO43556 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCEO43556 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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