Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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