Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms