Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms