Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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