Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms