Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms