Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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