Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SNAPC1Q16533 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SNAPC1Q16533 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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