Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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