Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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