Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms