Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms