Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms