Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFNP31947 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFNP31947 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFNP31947 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SFNP31947 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFNP31947 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFNP31947 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFNP31947 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFNP31947 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms