Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CCDC179H3BU77 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms