Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CFAP73A6NFT4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms