Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms