Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms