Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms