Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms