Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXNL1Q96CM4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms