Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms