Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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