Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms