Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms