Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms