Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
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GRIN2AQ12879 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
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GRIN2AQ12879 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
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GRIN2AQ12879 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
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