Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA11P31270 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms