Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms