Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DESP17661 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DESP17661 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DESP17661 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms