Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms