Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB3O43889 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms