Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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